Ngoài các môn học bắt buộc gồm Toán, Ngữ văn, Tiếng Anh, Lịch sử, Trải nghiệm hướng nghiệp và Giáo dục địa phương, Trường THPT Thủy Sơn đáp ứng yêu cầu các tổ hợp môn học sau:
• Mỗi học sinh trúng tuyển được đăng ký lựa chọn 01 tổ hợp theo lớp
• Số học sinh mỗi lớp không quá 45; 02 học sinh tuyến thẳng biên chế A9, A10
• Thời gian đăng ký sẽ có thông báo cụ thể tại bảng dân của nhà trường.